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El recuento de linfocitos CD4+ es el marcador pronóstico que más se ha utilizado, el cual se correlaciona bien con las fases tardías de la infección, no siendo tan útil para predecir el efecto de una terapia antirretrovírica de forma temprana en el curso de la infección.
Se hacen necesarios métodos sensibles de cuantificación de la replicación vírica. Se descubre la carga vírica como un buen marcador pronóstico de la evolución de la infección.
Los estudios avalan la teoría de que a niveles altos de carga vírica, mayor riesgo de progresar a SIDA. Los niveles de carga vírica son un parámetro importante a la hora de evaluar la eficacia de los tratamientos.
