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Actualmente se conoce que la replicación vírica es continua y elevada durante todas las fases de la infección. Cada día se renueva un 30% de la carga vírica. La consecuencia final de esta lucha es el agotamiento del sistema inmune y el desarrollo de la enfermedad conocida como SIDA.
La alta replicación del VIH provoca la aparición de mutaciones y con ello una rápida aparición de resistencias a fármacos. Las principales ventajas teóricas derivadas del uso de la terapia combinada son:
a) Prevenir el desarrollo de resistencias.
b) Reducir la toxicidad de los fármacos.
c) Conseguir un efecto sinérgico de la actividad antirretrovírica.
