Introducción. La endocarditis infecciosa (EI) es un reto médico actual debido a que todavía presenta gran morbimortalidad. Las complicaciones neurológicas aparecen en el 20-40% de los pacientes, y el cerebro es la principal localización de las complicaciones extracardíacas de las EI. Objetivo. Analizar las características clínicas de los pacientes con manifestaciones neurológicas debidas a EI, y centrarnos en los problemas diagnósticos y pronósticos que presentan. Pacientes y métodos. Se realizó un estudio retrospectivo de todos los pacientes diagnosticados de EI en los hospitales de Valme y de la Merced, entre los años 1998 y 2003. Posteriormente, se compararon los grupos de pacientes con EI y manifestaciones neurológicas con los que no las presentaron. Obtuvimos una muestra de 60 casos de EI. Resultados. Las manifestaciones neurológicas aparecieron en 12 pacientes (20%). La manifestación neurológica más frecuente fue la clínica focal en forma de hemiparesia en siete casos (58,3%); en tres casos apareció un síndrome confusional agudo (25%) y los dos pacientes restantes presentaron síndrome meníngeo. Los hallazgos de neuroimagen fueron: infartos isquémicos en seis casos (50%), seguidos de hemorragia cerebral en dos pacientes (16,6%), y no existieron hallazgos significativos en los restantes. Los pacientes con EI y manifestaciones neurológicas presentaron una mayor mortalidad (p < 0,001) y mayor frecuencia de hemocultivos negativos (p < 0,001) que los que no presentaban clínica neurológica. Conclusiones. Las complicaciones neurológicas de la EI son frecuentes durante la evolución de la enfermedad y todavía constituyen un grave problema en la clínica diaria por sus dificultades diagnósticas y elevada mortalidad.