Introducción. En el sonambulismo, un trastorno caracterizado por un despertar parcial, se refiere una alteración de la microestructura del sueño que puede influir en la actividad autónoma durante el sueño y la vigilia. Objetivo. Para evaluar una posible desregulación autónoma en los pacientes con sonambulismo durante el sueño y la vigilia, realizamos un análisis espectral de la variabilidad del ritmo cardíaco (VRC) durante el sueño y la vigilia. Sujetos y métodos. En el grupo de 10 sonámbulos y de 10 sujetos normales se realizó el análisis espectral de la VRC durante el sueño y durante la vigilia en la posición horizontal y vertical, y un análisis del patrón de la activación cardíaca durante varios tipos de despertar. Resultados. El grupo de sonámbulos y el grupo de control no difirieron en los parámetros del análisis espectral de la VRC durante el sueño y en la posición horizontal durante la vigilia. En los sonámbulos se demostró un mayor cambio del equilibrio simpaticovagal en beneficio de la actividad simpática, en respuesta a la verticalización. Durante las secuencias de 5 minutos inmediatamente anteriores al inicio del despertar patológico en los sonámbulos, se observó el incremento de la energía total del análisis espectral de la VRC. El patrón de la activación cardíaca durante varios tipos de despertar no difirió entre los pacientes y los sujetos normales. Conclusiones. Se evidenció una alteración de la reactividad autónoma en respuesta a la carga ortostática en sonámbulos, lo que puede ser la consecuencia de la inestabilidad del sueño en estos pacientes. El incremento de la energía total del análisis espectral de la VRC, inmediatamente antes del despertar patológico durante el sueño NREM 4 en sonámbulos, sugiere que la activación autónoma precede el despertar cortical.